После революции Троекуровский монастырь постигла судьба всех русских православных обителей. В 1930 г. местные власти окончательно закрыли обитель, однако многие сестры до конца своих дней прожили на территории монастыря, основная часть которого в советское время была приспособлена под предприятие по переработке плодов и ягод. Монастырские постройки постепенно приходили в упадок и разрушались.
Со временем забыли и про пещеру с гробом подвижника. Но было угодно Господу явить нам мощи святого своего угодника. 13 июля 1999 года состоялось обретение честных мощей Илариона Троекуровского. Они были перенесены в Михайло-Архангельский храм, где покоятся и в настоящее время, вновь являя чудеса чудотворений и исцелений. В октябре 2003 года Священный Синод Русской Православной Церкви принял решение о восстановлении в селе Троекурово Липецкой и Елецкой епархии Свято-Димитриевского Иларионовского женского монастыря. Вновь зазвонили колокола, возвещая о возрождении обители, о возрождении духовной жизни на Лебедянской земле.
